青海發光桿菌當霉菌孢子落在適宜的基質上后，就發芽生長并產生菌絲，由許多菌絲相互交織而成的一個菌絲集團稱菌絲體（mycelium，復數，mycelia）。菌絲體分兩類，密布在固體培養基質內部，主要執行吸取營養物功能的菌絲體，稱營養菌絲體（vegetaive mycelium）；而伸展到空間的菌絲體，則稱氣生菌絲體（aerial mycelium）。這兩類菌絲體在長期的進化中，因自身的生理功能和對不同環境的高度適應，已明顯發展出各種特化的構造。
1，營養菌絲體的特化形態
1)假根（rhizoid）是Rhizopus（根霉屬）等低等真菌葡萄菌絲與固體基質接觸分化出來的根狀結構，具有固著和吸取養料等功能。
2）葡萄菌絲（stolon）又稱葡萄枝。毛霉目（Mucorales）真菌在固體基質上常形成與表面平行、具有延伸功能的菌絲，辰葡萄菌絲。zui典型的可在Rhizopus中見到。在固體基質表面的營養菌絲分化為葡萄菌絲，在其上每隔一段距離可長出深入基質的假根和伸向空間的孢囊梗，隨著葡萄菌絲的延伸，不斷形成新的假根和孢囊梗，這類真菌會隨基質的存在而向四處快速蔓延，根本就不會形成像在其他真菌中常見的那樣固定大小和形態的菌落。
3）吸器（haustorium）由幾類專性寄生的真菌如繡目菌（uredinales）、霜霉目（peronosporales）的話的一些種所產生。吸器是一種只有在宿主細胞間隙間蔓延的營業菌絲上分化出來的短支，她可在侵入細胞內形成指狀或者球狀，絲狀的構造。用以吸取宿主細胞內養料而不是其致死。
4)附著枝（adhesive branch）若干寄生真菌如asteridiella homalii-angustifolii（小光殼炱）和irenina（禿殼炱屬）等，由菌絲細胞生出1-2個細胞的短枝，將菌絲附著于宿主體上，此即附著枝。
6）青海發光桿菌菌核（sclerotium）是一種形狀，大小不一的休眠菌絲組織，在不良外界條件下，微生物菌種查詢網可保存數年生命力，菌核形狀有大有小，大的如茯苓（大如小孩頭），小的如油菜菌核（形如鼠糞）。菌核的外層顏色深，堅硬，內層疏松，大多呈白色。
7)菌索（rhizomorph funiculus）菌索一般是有傘菌如armillaria mellea（假蜜環菌）等產生，為白色根狀菌絲組織，功能為促進菌體蔓延和抵御不良環境，通常可在腐朽的樹皮或地下發現。
8）密環（ring）和菌網（net）捕蟲菌目（zoopagales）和一些半知菌的菌絲常會分化成菌環或網狀的特化菌絲組織，用以捕捉線蟲或其他微小動物，然后進一步從這類環或網上生出菌絲侵入線蟲等體內，吸取養料。線蟲是生存于土壤中危害植物根部并影響作物生長和產量的有害動物。種類很多（約2.5萬種），青海發光桿菌用真菌防止線蟲有良好的前景。
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