簡單地說：如果費氏弧菌發光桿菌污染，本身帶有雜菌，將直接導致菌包的污染，這里指的菌種包含母種、原種、栽培種，關于液體菌種將在以后專門論述，栽培種引起的污染嚴重時表現為在菌種部位出現雜菌，在接種后幾天內就可以表現出來。
在實際中，誰也不會將能夠看出來有雜菌的栽培種接入到菌包中，雜菌大多都是“隱性”的形式存在于栽培種中，要解決因菌種引起的污染，就必須從菌種的質量抓起，需要注意以下幾點：
1，一定要自己制作菌種
這里是指具備一定的設備條件和技術條件，才能自己制作菌種，自己制作的菌種全過程都是自己嚴格控制，質量和純度才是有保證的，反之，購買的菌種因為本身質量，以及長距離的運輸等，都容易出現問題，特別是夏季從外地購買菌種，如果不使用冷藏車，在運輸的過程中很容易導致活性下降和污染。
當然，如果你附近有質量可靠的菌種廠，也是可以使用購買的菌種，從長期發展，將會出現越來越多的專業菌種廠。
2，避免使用老化菌種
因使用老化菌種引起的污染比較普遍，老化菌種一般指的是存放時間較長，或者是經過低溫保藏的菌種，老化的菌種自身容易受到雜菌侵染，嚴重時肉眼可以看到，輕微感染或者是細菌感染，從外觀上是很難觀察到的，而接到菌包后，雜菌就具有了合適的生長條件，表現為污染。
老化的菌種，還表現為活性下降，接到菌包后費氏弧菌發光桿菌萌發速度慢，嚴重時會出現不萌發的情況，這樣就會給雜菌提供生長的機會，導致污染率增加，在食用菌工廠化中很少使用老化菌種，但是對于普通栽培戶來說，因為大多不具備制種能力，因使用老化菌種導致污染的情況時有發生。
微管相關蛋白IgG 大鼠色素P450(CYP450)
微小染色體維持缺陷蛋白2IgG 大鼠色素C(Cyt-C)
微小染色體維持缺陷蛋白3IgG 大鼠三碘甲狀腺原氨酸(T3)
微小染色體維持缺陷蛋白5IgG 大鼠乳腺癌標志物-CA153
微小染色體維持缺陷蛋白7IgG 大鼠乳鐵傳遞蛋白/乳鐵蛋白(LF/LTF)
維甲酸受體-α IgG 大鼠乳酸脫氫酶(LDH)
維甲酸受體-βIgG 大鼠肉毒堿脂酰轉移酶(CACT)
維生素D結合蛋白IgG 大鼠絨毛膜促性腺激素β(β-CG)
尾型同源盒轉錄因子2IgG 大鼠絨毛膜促性腺激素(CG)
胃蛋白酶原CIgG 大鼠妊娠相關血漿蛋白A(PAPP-A)
費氏弧菌發光桿菌
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